Красная Армия. Полковники. 1935-1945 гг. Том 76

Оставшийся личный состав передан на укомплектование 149-й стрелковой бригады, а штаб дивизии и штабы частей (за исключением 524-го стрелкового полка) были отведены на левый берег Волги в район хут. Рыбачий. Затем управления дивизии и частей были передислоцированы в Саратовскую обл. в район г. Аткарск на переформирование. В этих условиях в середине ноября Я. Д. Филоненко временно вступил в должность командира дивизии (вместо отстраненного от командования полковника И. Е. Ермолкина). После завершения формирования дивизии и прибытия нового командира с 13 января 1943 г.

Я. Д. Филоненко вновь вступил в должность зам. командира дивизии по тылу и оставался в ней до конца войны. С июля 1943 г. дивизия в составе 60-й армии Центрального фронта участвовала в Курской битве, освобождении Левобережной Украины, битве за Днепр, Черниговско-Припятской наступательной, Киевских наступательной и оборонительной операциях. С января 1944 г. в составе 13-й армии 1-го Украинского фронта она принимала участие в Житомирско-Бердичевской, Ровно-Луцкой, Проскуровско-Черновицкой, Львовско-Сандомирской наступательных операциях. За отличия в этих боях дивизия была награждена орденами Суворова 2-й ст. и Красного Знамени. На завершающем этапе войны в составе 1-го Украинского фронта части дивизии участвовали в Висло-Одерской и Сандомирско-Силезской наступательных операциях, в штурме города и крепости Бреслау. За эти бои она была награждена орденом Кутузова 2-й ст. Командир 112-й стрелковой дивизии генерал-майор А. В. Гладков (командовал дивизией с августа 1943 г. до января 1945 г.) высоко оценивал личный вклад Я. Д. Филоненко в достижении этих побед дивизии. Он отмечал, что тот «в период наступательных боев дивизии… несмотря на значительный некомплект транспорта и большие переходы, сумел бесперебойно и своевременно обеспечить передовые части дивизии боеприпасами, продовольствием и обмундированием… Часто бывает непосредственно на передовой линии, интересуясь запросами личного состава и своевременно их удовлетворяет. В боевой обстановке смел, решителен и принимает разумные решения». После войны полковник Я. Д. Филоненко продолжал служить в дивизии в той же должности. С августа 1946 г. и. д. зам. командира по тылу 34-го гвардейского стрелкового корпуса ПрикВО, с ноября 1947 г. служил в той же должности в 29-м гвардейском стрелковом корпусе 8-й гвардейской армии ГСОВГ, с января 1951 г. – в 73-м стрелковом корпусе 38-й армии ПрикВО в г. Дрогобыч. В марте 1954 г. уволен в запас.