Пароходо-корвет «Америка» и его командир А. А. Болтин

Помимо этого в функции Охотской флотилии входило обеспечение научно-исследовательских экспедиций на Тихом океане. Изредка её суда перевозили войска для Анадырской партии, созданной для покорения «немирных» чукчей. Товаро-пассажирские перевозки занимали основную часть времени во время навигации, но самые яркие моменты в истории Охотской флотилии в XVIII веке связаны с её участием в исследовательских экспедициях. Среди них можно назвать экспедицию С.П. Крашенинникова

на Камчатку в 1731-1741 гг., Вторую Камчатскую экспедицию капитан-командора В.

И. Беринга

и капитана А.И. Чирикова

в 1733-1743 гг., Охотско-Курильскую экспедицию М.П. Шпанберга

в 1733-1743 гг., Северо-Восточную географическую и астрономическую морскую экспедицию капитан-поручика И.И. Билингса

и капитана Г.А. Сарычева

в 1785-1793 гг., плавание поручика Адама Лаксмана

в Японию в 1792-1793 гг. с целью установления торговых отношений с Японией и ряд других известных плаваний.

Использование Охотской флотилии в этих целях стало привычным делом, но при таком положении не могло быть и речи о защите интересов Росси на Тихом океане.

Частично эти задачи стали выполнять суда Балтийского флота, отправлявшиеся в кругосветные плавания на Дальний Восток. Первыми судами, совершившими такое плавание в 1803?1806 гг., были шлюпы «Нева» и «Надежда» под командованием И.Ф. Крузенштерна

и Ю.Ф. Лисянского

. Затем такое путешествие совершил в 1817-1818 гг. шлюп «Камчатка» под командованием капитана 2-го ранга В.

М. Головнина

. За ним последовали более десяти других судов. Таким образом, на Дальнем Востоке, помимо Охотской флотилии, кораблей Российско-Американской компании, появилась третья военно-морская составляющая – корабли Балтийского флота.

Заметное оживление военно-морского присутствия России на Дальнем Востоке в 1850-е годы началось после назначения на пост генерал-губернатора Восточной Сибири Н.Н. Муравьёва

. Происходит несколько важных событий.

Одно из них связано с деятельностью на Дальнем Востоке выдающегося первооткрывателя Г.И. Невельского

. Благодаря деятельности Амурской экспедиции (1849-1855 гг.)

под его руководством, Россия приобрела земли в нижнем течении реки Амур, приморское побережье до Императорской (ныне Советской) гавани и остров Сахалин. К Амурской экспедиции Г.И. Невельского были приписаны транспорты Охотской флотилии «Байкал» и «Охотск».